Tijdens de verbouwing beperkt de Coördinatie Stationseiland de overlast voor reizigers en omwonenden zoveel mogelijk, door het nemen van maatregelen die bereikbaarheid, leefbaarheid en veiligheid verbeteren. De Coördinatie voert zo de regie over het gebied Stationseiland.
Om te onderzoeken of het Stationseiland bereikbaar blijft, worden toekomstige verkeerssituaties gesimuleerd in het voetgangersmodel en het dynamisch verkeersmodel.
Op de achterzijde van de winkels aan de westelijke voetgangersroute wordt sinds 2004 kunst aangebracht. De werken zijn 45 meter lang en 3 meter hoog. De kunstwerken worden gemaakt in opdracht van de Coördinatie.

De Coördinatie Stationseiland ziet toe op het aantal stallingsplaatsen tijdens de bouw. Daartoe worden diverse maatregelen genomen.
